Software for Digital microscopy

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Unser Business

Für die prä- und klinische Forschung und Diagnostik ist es wichtig, dass medizinische Bilder nicht nur Bilder sind, Diagnostikberichte nicht nur unstrukturierte Informationen sind aber auch dass die molekularen Daten automatisch ausgewertet und nicht von den Ergebnissen der Bild- und Textanalyse getrennt sind.
Genau das ist die Expertise von HS Analysis GmbH seit 2015. Die autonomen AI Systeme unterstützen die Forscher und Ärzte bei der automatisierten Quantifizierung und Prädiktion der medizinischen Daten. So können die Forscher und Ärzte ihr Expertenwissen effizienter einsetzen und sich auf die Forschung bzw. Krankheit konzentrieren. Wenn es um die automatisierte Bildanalyse, Wissen aus Publikationen und Berichten und der Analyse sowie Prädiktion aus molekularen Daten geht, ist die Integration der entsprechenden AI in die Hardware und die Infrastruktur eine der Hauptkompetenzen der HS Analysis GmbH.
Das Unternehmen arbeitet weltweit eng mit verschiedenen Partnern zusammen, wenn die Digitalisierung und Automatisierung Teil der täglichen Routine im Lab oder Krankenhaus ist. Mit Hilfe der eigen geschriebener Deep Learning Architektur, Active und Transfer Learning setzt die HS Analysis weltweit den Standard in der diagnostischen Prädiktion beispielsweise CDx sowie der Früherkennung von seltenen Erkrankungen oder Krebsarten.

technology

Technologie

Die modernsten Technologien im Bereich der künstlichen Intelligenz ermöglichen die automatische Interpretation der Gewebeproben und Zellkulturen. Genaugenommen werden mit Deep Learning Verfahren Digitalbilder, die mit Slide Scanner und HCS, einer Art Mikroskopier-Roboter entstehen analysiert. Ergebnis der Analyse ist die zuverlässige und schnelle Quantifizierung der Effekte der Wirkstoffkandidaten auf das Gewebe und Zellkulturen.

Spezialisten von HS Analysis beherrschen unterschiedliche Technologien. Die Wahl der optimalen Technologie hängt stark von den Anforderungen des Kunden ab. Im Folgenden sind 2 Beispiele aufgeführt:

Digitale Mikroskopie ist eine vielversprechende Methode für quantitative Automatisierung in der Erforschung neuer Medikamente. Das Schlüsselelement ist die Einführung des Whole-Slide Imaging (WSI) mit Digitalscannern. Sie erlauben die Virtualisierung der ganzen Gewebeprobe auf dem Objektträger oder Zellkulturen auf einer Well-Platte in hoher mikroskopischer Auflösung.
Durch die Kombination von WSI und Well-Platten mit automatischer Detektion und Quantifizierung durch Software entstehen viele neue Möglichkeiten in der Erforschung neuer Medikamente gegen Krankheiten.
HS Analysis entwickelt Ihre Lösung für die automatische Auswertung von WSI für die effiziente Gestaltung von Workflows in der Pharmaforschung.
Fortschritte bei künstlichen neuronalen Netzen erlauben heute die zuverlässige Erkennung von Strukturen mit komplexer Morphologie.
Damit Forscher und Pathologen in Unikliniken und der Pharmaindustrie schnell Antworten auf entscheidende Fragen im Krankheitsgeschehen finden können, stellt HS Analysis GmbH Software für automatische Analyse von Gewebeproben und Zellkulturen bereit. Dafür werden u.a. neuronale Netze sowie Deep Learning eingesetzt. Sie helfen, Ihre Region of Interest (ROI) automatisch zu erkennen und auszuwerten. So vermeiden Sie zeitaufwändige manuelle Annotation von ROIs und erreichen Analysen in hohem Durchsatz und kurzer Berechnungszeit.
details

Details

Zellverfolgung und -analyse in Echtzeit

HSA intern entwickeltes Deep Learning


Verfolgen von Veränderungen der zellulären Morphologie und des Verhaltens in Abstimmung mit den umgebenden Zellen. Zellen mit zunehmender Fläche sind blau, mit abnehmender Fläche rot markiert. Länge der einzelnen Zellgrenzen, Umfang, Fläche und Perzentilveränderung im Vergleich zum vorherigen Bild (Δ Fläche, Δ Umfang) werden in Echtzeit verfolgt.

Eigenentwickelte KI-Netzwerke:
  • + Zellenrand-Lücken im Originalbild werden intelligent geschlossen
  • + Automatische Verfolgung der Länge der individuellen Zellgrenzen, der Änderungen der Zellmorphologie und des Verhaltens in Abstimmung mit den umgebenden Zellen
  • + Visuelle Darstellung ausgewählter Morphologieänderungen (Fläche, Zirkularität, Verhalten der Nachbarzellen usw.)
  • + Einfacher Export aller statistischen Daten in eine Exel-Datei

 

Standard Deep Learning U-Net


Einfache intensitätsabhängige Annotation der Zellgrenzen gegenüber dem Originalbild




Altes U-Net basierendes KI Netzwerk:
  • - Lücken im Originalbild werden nicht geschlossen, wodurch die anschließende statistische Analyse beeinträchtigt wird
  • - Verfolgung zellulärer Parameter schwierig oder nur durch zusätzliche Programme möglich
  • - Keine visuelle Darstellung ausgewählter Veränderungen der Zellmorphologie

Zählung und Segmentierung von
Zellen in Kammerobjektträgern

Nachweis und Segmentierung von Kernen und Zytoplasma in kultivierten Zellen in Kammerobjektträgern.



Segmentierung von Tumor
und Stromazellen

Segmentierung von Kernen und Zytoplasma in Tumorzellen und zytoplasmatischen Regionen in Stromazellen. Wenn die Kernfärbung nicht vorhanden oder unspezifisch ist, können Kerne durch Kern-"Löcher" in der Zytoplasmafärbung nachgewiesen werden.

Analyse der Niere

Segmentierung von Glomeruli und Tubuli unter Verwendung eines Deep-Learning-Modells für Brightfield Daten.

Analyse der Niere

Segmentierung der Glomeruli und ihrer Kompartimente unter Verwendung eines Tensorflow-Modells für Brightfield Daten.

Intrazelluläre Kompartimente in EM

Die Ultrastrukturanalyse intrazellulärer Kompartimente mittels Elektronenmikroskopie liefert neue Einblicke in zelluläre Feinstrukturen und subzelluläre Organellen-Interaktionen.



Zählen von Zellen

Segmentierung und Zählung von Zellen.  



Internalization

Analyse der Insulinrezeptoren innerhalb und außerhalb des Zytoplasmas und die Veränderung im Laufe der Zeit.


Scratch Assay

Analyse von Proben mit Kratzern und der Veränderung der Zellfläche über die Zeit.

 
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Proliferation

Segmentierung von Zellen im Laufe der Zeit zur Messung der Zellproliferation. Die Analyse wird auf Label Free Data durchgeführt.

Kolorektales Karzinom

Segmentierung von Brightfield Daten mit kolorektalem Karzinom mit Hilfe eines Deep Learning Modells.

Analyse der Lunge

Automatisierte Einstufung von Tumoren bei nichtkleinzelligen Bronchialkarzinom (NSCLC) und Quantifizierung von Tumoren/Stromas.

Software for the containment of region of interests (ROI)

Manual drawing of regions of interests (ROI) or automatic ROI definition after learning the software. The analysis then takes place only in the marked regions (ROI) and different analysis methods can be assigned to different ROI types in one image.

Screening with cancer markers

Tissue analysis with cancer-specific markers such as Ki67, p21, p53, stathmin, bTubulin, etc.

TMA Screening & Analysis

Analysis of Tissue Micro Arrays (TMA) with any number of cores. Semi-automatic name assignment of the cores and link to their analysis results. Automatic export of analysis results to Excel tables.

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Image Analysis Online Service

Lösung für Ihr Assay:
Wiederholte Aufgaben in Ihrem Workflow können wertvolle Zeit in Anspruch nehmen, damit bahnbrechende Ideen verwirklicht werden können. HS Analysis bietet Onlinedienste für Bildanalyse an, mit denen Sie die Ergebnisse Ihrer zeitaufwändigsten und anspruchsvollsten manuellen Assay-Analysen verbessern können.

Bildanalyse leicht gemacht:
Ihre Bilder werden von unseren hochprofessionellen Bildanalyse-Experten in Deutschland manuell analysiert. Vereinfachen Sie Ihren quantitativen Bildanalyseprozess, indem Sie Ihre Aufgabe kurz beschreiben, Ihre Daten auf unseren Server hochladen und Ihre Ergebnisse täglich per E-Mail erhalten. Sie erhalten Reproduzierbare, zuverlässige Quantifizierungen, ohne dass Sie neue Hardware oder Software kaufen müssen.

Ergebnisse, die einen Unterschied machen:
Objektive, zuverlässige Daten zu extrahieren, um Ihre Forschung voranzutreiben, ist unsere Ziel. Ganz gleich, wie komplex Ihr System ist oder welches Problem Sie angehen möchten, wir entwickeln eine Lösung, mit der Sie Ihre Arbeit optimieren können. Sie machen die Bilder, wir machen den Rest.

Analysieren Sie Ihre Bilder jederzeit und überall:
Befolgen Sie diese einfachen Schritte, um die Ergbnisse zu genießen. Es ist so einfach wie es sich anhört:

  1. Füllen Sie Ihre Daten in das Kontaktformular.
  2. Beschreiben Sie die Aufgabe.
  3. Laden Sie die Bilder für die Analyse hoch.
  4. Nach der Bearbeitung Ihrer Bilder bekommen Sie eine E-Mail benachrichtigung mit den Ergebnissen und einer Rechnung.


    20 images - 250€50 images - 350€100 images - 400€250 images - 450€500 images - 500€1000 images - 550€5000 images - 750€10000 images - 1000€


    projects-two

    Projekte

    Fachkräfte in der Pharmaforschung, den Biowissenschaften und Forscher in Unikliniken stehen unter Druck, Ihre Arbeit zu optimieren, Zeitaufwand und Kosten zu reduzieren.

    HS Analysis bietet hierfür mit der präzisen Daten- und Bildanalyse eine passende Softwarelösung an.
    Somit wird der Mediziner bzw. Forscher unterstützt genaue, reproduzierbare Daten bereitzustellen. Menschliche Fehler, die oft durch die manuelle Auswertung entstehen werden eliminiert und Ergebnisse in kürzester Zeit aus einer sehr großen Datenmenge qualitativ gewonnen und analysiert. So können Sie ständig steigende Anforderungen erfüllen.

    congress

    Events

    Du findest uns auf:

    Netzwerk Deutschlandstipendium Karlsruhe Logo
    27. Januar 2020
    3 Gründer erzählen von ihren Erfahrungen die eine Unternehmensgründung mit sich bringt und berichten aus unterschiedlichen Phasen der Gründung
    Großer Saal, Gastdozentenhaus
    Engesserstraße 3, 76131 Karlsruhe

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    Industrie & Innovationstag Logo
    28. Februar 2020 von 4:00 to 6:00 Uhr
    3. Industrie & Innovationstag.
    Internationales Wissenschaftsforum Heidelberg (IWH),
    Hauptstraße 242, Heidelberg

    More Information

    Scion Logo
    23.-25. Oktober 2020
    Scion : Vertrauen in KI
    Technologiefabrik – Haid-und-Neu-Straße 7, Karlsruhe

    Weitere Informationen

    Vergangenen Events

    Scion Logo
    30. November 2019
    Scion: Vertrauen in KI
    Technologiefabrik – Haid-und-Neu-Straße 7, Karlsruhe

    More Information

    26. September 2019
    Vertrauen in die KI schaffen und dem Mittelstand Profitabilität sichern.
    Wirtschfaftsforum Ettlingen

    Weitere Informationen

    W3 Fair
    19. Semptember 2019
    Vortrag: Vertrauen in KI - Mythos oder Realität?
    Dornbirn (Vorarlberg)

    Weitere Informationen

    Zukunftstüftler Logo
    18. September 2019
    Zukunftstüftler – die Konferenz für die Köpfe der digitalen Transformation
    in der Technologiefabrik Karlsruhe

    Weitere Informationen

    BioLAGO Logo
    7. Juli 2019
    Sieben Karlsruher Kreative haben sieben Minuten Zeit, sich und ihr Unternehmen zu präsentieren.

    Veranstaltung auf Facebook
    Weitere Informationen

    BioLAGO Logo
    27. Juni 2019 BioLAGO „Drugs, Diagnostics, Devices & Data – Matchmaking with Ireland”
    Vortragsthema: „Künstliche Intelligenz: Deep Learning in der Medizin, Mythos oder Realität?“

    Weitere Informationen

    20. Mai 2019
    2nd European Pathology Congress in Berlin
    Vortrag zum Thema Opportunities and risks of AI integration in daily routine in pathology today

    Weitere Informationen

    Etengo-Symposium
    16. Mai 2020
    Etengo-Symposium 2019
    Workshop zur Anwendung von Deep Learning in Bildanalyse
    WIRSOL Rhein-Neckar-Arena in Hoffenheim

    Weitere Informationen

    DBT
    9. April 2019, 10-17 Uhr
    Deutschen Biotechnologietage (DBT) Symposium
    Vortrag zum Thema Bio-Daten und Deep Learning
    In Würzburg

    Weitere Informationen

    Scion
    26. – 28. Oktober 2018
    2: Scion : Vertrauen in KI
    Technologiefabrik – Haid-und-Neu-Straße 7, Karlsruhe

    Weitere Informationen

    House of Pharma
    11. September 2018
    Auf der Spitze des Hype Cycles: Wie Deep Learning die Entwicklung neuer Wirkstoffe und Therapien mit signifikanter Zeit- und Kostenersparnis ermöglichen wird.
    Frankfurt am Main

    Weitere Informationen

    IHK
    5. Juli 2018, 14-18.00 Uhr
    Erster Tag der Künstlichen Intelligenz
    IHK Karlsruhe

    Weitere Informationen

    Scion
    23 + 24 Juni 2018
    1: Scion : Vertrauen in KI
    Technologiefabrik – Haid-und-Neu-Straße 7, Karlsruhe

    Weitere Informationen

    Steinbeis
    Freitag, 15. Juni 2018
    Maschinelles Lernen: Produktionsanwendungen in der Robotik
    ZKM – Zentrum für Kunst und Medien, Karlsruhe

    Weitere Informationen

    CEBIT
    14. Juni 2018
    CEBIT
    Hannover

    Weitere Informationen

    Michelin
    12. Juni 2018 16-20:00 Uhr
    Qualitätssicherung mit VR und KI
    Michelin Reifenwerke Karlsruhe

    Weitere Informationen

    Unser Blog:

    System-Integration AI Vision – Gesture Recognition

    Kassenlose Einkaufsfilialen – ein Schritt in die Zukunft? Amazon schreitet mit seiner „Just Walk Out“ Technologie Richtung autonomen Einzelhandel. Am 4. März dieses Jahres eröffnet Amazon seinen ersten kassenlosen Supermarkt in Europa. Das Konzept ist für Händler und Verbraucher angenehm unkompliziert. Beim Betreten des Ladens authentifiziert sich der Kunde via App und wird mittels framebasierter […]

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    Eines unserer Projekte – Das HSA Kit

    Eines unserer Projekte – Das HSAKit | Haid-Und-Neu-Str. 7 Karlsruhe 76131 Die Entwicklung im Bereich der Artificial Intelligence schreitet immer weiter fort. So werden computergestützte Assistenzsysteme in fast allen Branchen immer häufiger eingesetzt, so auch in der Medizin. In der Studie „AI in Europe – Ready for Take-Off“ der europäischen Initiative „European Information Technology Observatory“ […]

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    Scion 2019 – Vertrauen in KI in der Medizin

    Scion 2019 – Vertrauen in KI in der Medizin | 30.11.19 um 09:00 Uhr in der Haid-Und-Neu-Str. 7 Karlsruhe 76131 Autonome AI Systeme in der medizinischen Forschung und Diagnostik zu etablieren, ist die tägliche Arbeit der Mitarbeiter der HS Analysis GmbH. Dieses Wissen möchten die Experten an die jungen Wissenschaftler und Studenten vermitteln und das […]

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    Rückblick: Scion Herbst 2018 „Vertrauen in KI“

    Nach all dem Tagesgeschäft, das uns in der Folge unserer Jahreskonferenz Scion schnell wieder ereilte, nehmen wir einen Rückblick auf Scion Herbst 2018 vor. Ein ganz großer Dank geht an unsere Partner und insbesondere an die Speaker, Teilnehmerinnen und Teilnehmer, ohne die Scion 2018 in dieser Größenordnung und mit einem solch positiven Widerhall überhaupt nicht […]

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