Software for Digital Histology

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Unser Business

Bei uns bekommen Sie Ihre persönliche Softwarelösung für automatische Analyse digitalisierter histologischer Gewebeschnitte sowie von Mikroskop-Bildern.

Analyse-Lösungen werden mit künstlichen neuronalen Netzen bzw. Deep Learning entwickelt.

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Technologie

Die modernsten Technologien im Bereich der künstlichen Intelligenz ermöglichen die automatische Interpretation der Gewebeproben. Genaugenommen werden mit Deep Learning Verfahren Digitalbilder, die mit Slide Scanner, einer Art Mikroskopier-Roboter entstehen analysiert. Ergebnis der Analyse ist die zuverlässige und schnelle Quantifizierung der Effekte der Wirkstoffkandidaten auf das Gewebe.

Spezialisten von HS Analysis beherrschen unterschiedliche Technologien. Die Wahl der optimalen Technologie hängt stark von den Anforderungen des Kunden ab. Im Folgenden sind 2 Beispiele aufgeführt:

Digitale Histologie ist eine vielversprechende Methode für quantitative Automatisierung in der Erforschung neuer Medikamente. Das Schlüsselelement ist die Einführung des Whole-Slide Imaging (WSI) mit Digitalscannern. Sie erlauben die Virtualisierung der ganzen Gewebeprobe auf dem Objektträger in hoher mikroskopischer Auflösung.
Durch die Kombination von WSI mit automatischer Detektion und Quantifizierung durch Software entstehen viele neue Möglichkeiten in der Erforschung neuer Medikamente gegen Krankheiten.
HS Analysis entwickelt Ihre Lösung für die automatische Auswertung von WSI für die effiziente Gestaltung von Workflows in der Pharmaforschung.
Fortschritte bei künstlichen neuronalen Netzen erlauben heute die zuverlässige Erkennung von Strukturen mit komplexer Morphologie.
Damit Forscher und Pathologen in Unikliniken und der Pharmaindustrie schnell Antworten auf entscheidende Fragen im Krankheitsgeschehen finden können, stellt HS Analysis GmbH Software für automatische Analyse von Gewebeproben bereit. Dafür werden u.a. neuronale Netze sowie Deep Learning eingesetzt. Sie helfen, Ihre Region of Interest (ROI) automatisch zu erkennen und auszuwerten. So vermeiden Sie zeitaufwändige manuelle Annotation von ROIs und erreichen Analysen in hohem Durchsatz und kurzer Berechnungszeit.
scope

Anwendungsbereiche

Our quality standards apply also in terms of service, technical expertise and advice.
Our dedicated employees are happy to assist you with know-how and experience in your daily business.

  • 3D Rekonstruktion & Analyse von Serienschnitten von Gewebe und Organen

    Anatomie

    3D Rekonstruktion & Analyse von Serienschnitten von Gewebe und Organen
  • Quantifizierung & Häufigkeitsverteilung von IHC-markierten Blutgefäßen in Gewebe und Tumorregionen (z.B. einsetzbar als Indikator für die Bösartigkeit des Tumors)

    Angiologie

    Quantifizierung & Häufigkeitsverteilung von IHC-markierten Blutgefäßen in Gewebe und Tumorregionen (z.B. einsetzbar als Indikator für die Bösartigkeit des Tumors)
  • Analyse der Darmwand, Villi & Krypten.

    Gastroenterologie

    Analyse der Darmwand, Villi & Krypten.
  • Glomeruli Detektion & Auswertung von interstitieller Fibrose in Niere

    Nephrologie

    Glomeruli Detektion & Auswertung von interstitieller Fibrose in Niere
  • Quantifizierung markierter Parameter in Haut.

    Dermatologie

    Quantifizierung markierter Parameter in Haut.
  • 3D Analyse von Gehirnregionen & Plaque Analyse bei Alzheimer.

    Neurowissenschaften

    3D Analyse von Gehirnregionen & Plaque Analyse bei Alzheimer.
  • Quantifizierung von Proliferationsmarkern wie z.B. Ki-67, p21, p53, Stathmin, H-Scoring usw.

    Onkologie

    Quantifizierung von Proliferationsmarkern wie z.B. Ki-67, p21, p53, Stathmin, H-Scoring usw.
  • Analyse von Lungen-Alveoli.

    Pneumologie

    Analyse von Lungen-Alveoli.
  • Quantifizierung von Osteon, Osteozyten, Haversscher Kanal, Volkman’s Kanal.

    Osteologie

    Quantifizierung von Osteon, Osteozyten, Haversscher Kanal, Volkman’s Kanal.
  • 3D Rekonstruktion & Analyse von Serienschnitten von Gewebe und Organen

    Anatomie

    3D Rekonstruktion & Analyse von Serienschnitten von Gewebe und Organen
  • Quantifizierung & Häufigkeitsverteilung von IHC-markierten Blutgefäßen in Gewebe und Tumorregionen (z.B. einsetzbar als Indikator für die Bösartigkeit des Tumors)

    Angiologie

    Quantifizierung & Häufigkeitsverteilung von IHC-markierten Blutgefäßen in Gewebe und Tumorregionen (z.B. einsetzbar als Indikator für die Bösartigkeit des Tumors)
  • Analyse der Darmwand, Villi & Krypten.

    Gastroenterologie

    Analyse der Darmwand, Villi & Krypten.
  • Glomeruli Detektion & Auswertung von interstitieller Fibrose in Niere

    Nephrologie

    Glomeruli Detektion & Auswertung von interstitieller Fibrose in Niere
  • Quantifizierung markierter Parameter in Haut.

    Dermatologie

    Quantifizierung markierter Parameter in Haut.
  • 3D Analyse von Gehirnregionen & Plaque Analyse bei Alzheimer.

    Neurowissenschaften

    3D Analyse von Gehirnregionen & Plaque Analyse bei Alzheimer.
  • Quantifizierung von Proliferationsmarkern wie z.B. Ki-67, p21, p53, Stathmin, H-Scoring usw.

    Onkologie

    Quantifizierung von Proliferationsmarkern wie z.B. Ki-67, p21, p53, Stathmin, H-Scoring usw.
  • Analyse von Lungen-Alveoli.

    Pneumologie

    Analyse von Lungen-Alveoli.
  • Quantifizierung von Osteon, Osteozyten, Haversscher Kanal, Volkman’s Kanal.

    Osteologie

    Quantifizierung von Osteon, Osteozyten, Haversscher Kanal, Volkman’s Kanal.
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Projekte

Fachkräfte in der Pharmaforschung, den Biowissenschaften und Forscher in Unikliniken stehen unter Druck, Ihre Arbeit zu optimieren, Zeitaufwand und Kosten zu reduzieren.

HS Analysis bietet hierfür mit der präzisen Bildanalyse eine passende Softwarelösung an.
Somit wird der Forscher unterstützt genaue, reproduzierbare Daten bereitzustellen. Menschliche Fehler, die oft durch die manuelle Auswertung entstehen werden eliminiert und Ergebnisse in kürzester Zeit aus einer sehr großen Datenmenge qualitativ gewonnen und analysiert. So können Sie ständig steigende Anforderungen erfüllen.

details

Glomeruli Detektion

Detektion von Glomeruli mit Hilfe eines angelernten Tensorflow Modells für Brightfield Daten.

Cell Counting

Segmentieren und Zählen von Zellen.
 

Internalization

Analyse von Insulin Rezeptoren innerhalb und außerhalb von Zytoplasma und die Veränderung über die Zeit.
Sie können diesen Workflow auf der digitalen Plattform APEER laufen lassen.

Scratch Assay

Analyse von Proben mit Kratzer und die Veränderung der Zellfläche über die Zeit.
Sie können diesen Workflow auf der digitalen Plattform APEER laufen lassen.

Echtzeit Detektion unter dem Mikroskop

Sie schauen durch das Mikroskop und sehen in Echtzeit Markierungen der für Sie relevanten Objekte.
Anschließend erfolgt eine automatische Quantifizierung der erkannten Objekte.
 

Blutgefäß-Analyse

Immunhistochemische Markierung von Blutgefäßen erlaubt das Zählen von Blutgefäßen und deren Flächenanteile in Gewebe.
Die Software ermöglicht ebenfalls das explizite Zählen von Tumoren sowie die Analyse deren Verteilung im Gewebe.

Software für die Eingrenzung von region of interests (ROI)

Manuelles Zeichnen von regions of interests (ROI) oder automatische ROI Definition nach Anlernen der Software. Die Analyse findet dann nur in den markierten Regionen (ROI) statt und verschiedene Analyse-Methoden können verschiedenen ROI Typen in einem Bild zugeordnet werden.

Screening mit Krebsmarkern

Gewebeanalyse mit krebsspezifischen Markern wie Ki67, p21, p53, Stathmin, bTubulin, usw.

TMA Screening & Analyse

Analyse von Tissue Micro Arrays (TMA) mit einer beliebigen Anzahl von Cores. Halbautomatische Namenszuordnung der Cores und Verknüpfung mit deren Analyse-Ergebnissen. Automatischer Export der Analyse-Ergebnisse in Exceltabellen.


Nieren-Glomeruli Detektion & Fibrose Auswertung

Software für das automatische Finden von Nieren-Glomeruli. Analyse der fibrotischen Veränderungen innerhalb von Nieren-Glomeruli. Analyse von interstitieller Fibrose.

congress

Events

Du findest uns auf:

cyberLAGO

20. Januar 2019
Inside Data Bodensee – cyberLAGO e.V.
Workshop zur Anwendung von Deep Learning in Bildanalyse
cyberLAGO e.V. – Blarerstraße 56, 78462 Konstanz

Weitere Informationen

DBT

9. April 2019, 10-17 Uhr
Deutschen Biotechnologietage (DBT) Symposium
Vortrag zum Thema Bio-Daten und Deep Learning
In Würzburg

Weitere Informationen

Etengo-Symposium

16. Mai 2019
Etengo-Symposium 2019
Workshop zur Anwendung von Deep Learning in Bildanalyse
WIRSOL Rhein-Neckar-Arena in Hoffenheim

Weitere Informationen

Vergangene Events

Scion

26. – 28. Oktober 2018
2: Scion : Vertrauen in KI
Technologiefabrik – Haid-und-Neu-Straße 7, Karlsruhe

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House of Pharma

11. September 2018
Auf der Spitze des Hype Cycles: Wie Deep Learning die Entwicklung neuer Wirkstoffe und Therapien mit signifikanter Zeit- und Kostenersparnis ermöglichen wird.
Frankfurt am Main

Weitere Informationen

IHK

5. Juli 2018, 14-18.00 Uhr
Erster Tag der Künstlichen Intelligenz
IHK Karlsruhe

Weitere Informationen

Scion

23 + 24 Juni 2018
1: Scion : Vertrauen in KI
Technologiefabrik – Haid-und-Neu-Straße 7, Karlsruhe

Weitere Informationen

Steinbeis

Freitag, 15. Juni 2018
Maschinelles Lernen: Produktionsanwendungen in der Robotik
ZKM – Zentrum für Kunst und Medien, Karlsruhe

Weitere Informationen

CEBIT

14. Juni 2018
CEBIT
Hannover

Weitere Informationen

Michelin

12. Juni 2018 16-20:00 Uhr
Qualitätssicherung mit VR und KI
Michelin Reifenwerke Karlsruhe

Weitere Informationen

Unser Blog:

Rückblick: Scion Herbst 2018 „Vertrauen in KI“

Nach all dem Tagesgeschäft, das uns in der Folge unserer Jahreskonferenz Scion schnell wieder ereilte, nehmen wir einen Rückblick auf Scion Herbst 2018 vor. Ein ganz großer Dank geht an unsere Partner und insbesondere an die Speaker, Teilnehmerinnen und Teilnehmer, ohne die Scion 2018 in dieser Größenordnung und mit einem solch positiven Widerhall überhaupt nicht […]

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Pathologie, Mikroskopie und automatisierte Bildanalyse

Privatdozentin Dr. Afsaneh Soruri hat an der Universität Göttingen Immunologie, Biochemie und Mikrobiologie studiert. Promoviert wurde sie auf dem Gebiet der Antigenpräsentation durch Dendritische Zellen. In Ihrer Habilitation beschäftigte sie sich mit dem Thema Migration und Reifung von Antigen-Präsentierenden-Zellen in vivo. Das besondere Interesse der Naturwissenschaftlerin gilt der Bedeutung der Antigenpräsentation im Tumorgewebe. In 2009 […]

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Scion Herbst 2018: Medikamentenforschung von Bayer und Pathologie aus Mannheim

Die Bayer AG wurde 1863 in Barmen, das heute zu Wuppertal gehört, von Friedrich Bayer (1825-1880) gegründet. Der Hauptsitz befindet sich gegenwärtig in Leverkusen. 2017 hatte Bayer einen Jahresumsatz von 35 Milliarden Euro. Das weltweit tätige Unternehmen mit knapp 100.000 Mitarbeitern ist in der chemischen und pharmazeutischen Industrie angesiedelt. Dr. Christoph Schatz hat in Berlin, […]

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Zeiss and HS Analysis cooperate in terms of Microscopy and Digital Image Analysis

Englisch Version (for German Version see below) Scion Herbst 2018 Forum & Hackathon (26.-28.10.18) is only a few days ahead. Beforehand we will talk about speakers who are going to contribute their expertise to the annual life science conference in Karlsruhe. The worldwide company Zeiss has a long history and tradition. Named after its founder Carl Zeiss […]

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Visionen von Ärzten aus Karlsruhe und Hamburg inspirieren die Pathologie

Mit Scion Herbst 2018 (26.-28.10.18) bietet die HS Analysis GmbH eine Plattform für den interdisziplinären Austausch rund um die Themen automatische Bildanalyse, Diagnostik und Therapie von Krankheiten sowie der Medikamentenforschung. Die Zusammenarbeit mit Pathologen aus ganz Deutschland ist für HS Analysis von großer Bedeutung. Bei unserer Jahreskonferenz zum Thema Life Science Ende Oktober dürfen sich die Teilnehmer auf Vorträge […]

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Services

HS Analysis arbeitet eng mit Ihnen zusammen um Ihre Lösung zielgerichtet zu entwickeln.
Sie bekommen eine modulare und skalierbare Lösung um die Bearbeitung Ihrer Studien zu beschleunigen, Zeit- und Kosten einzusparen und eine höhere Kapitalrendite zu erzielen. Auch für Sie bieten wir die richtige Lösung an. Seien Sie ganz vorne mit Ihrer Forschung auf dem Markt dabei.

HSA ist ein Unternehmen, das durch seine Ausrichtung und bisherigen Projekte bewiesen hat, seinen Kunden insbesondere in der Pharmabranche einen nachhaltigen Mehrwert zu bieten.

management

TEAM

Das Team hat sich am KIT (Karlsruher Institut für Technologie) zusammen gefunden und verfolgt das gemeinsame Ziel das Unternehmen HS Analysis zum Standard der automatisierten Smart Data Analyse zu etablieren.

Das Unternehmen beschäftigt IT Spezialisten, die moderne Ansätze im Bereich der künstlichen Intelligenz nutzen und valide Serverarchitektur aufsetzten. HS Analysis ist davon überzeugt, dass nicht nur die Algorithmik für die Automatisierung relevant ist, sondern gleichermaßen das Design. Somit beschäftigt HS Analysis auch Wissenschaftler und Künstler, die bestehende Prozesse hinterfragen und neue Vorschläge für Life Science liefern. Diese Kombination aus Experten in Design Thinking, Data Science und Deep Learning Ansätzen ist einzigartig und ist insbesondere für Produkt-, Forschungs- und IT-Abteilungen von Interesse.

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